Emplois, stages

Le LESIA est un des plus gros laboratoire français de recherche en astrophysique ( 236 personnes, dont 75 chercheurs et 69 ITA). Il est organisé en 4 pôles dont le pôle haute résolution angulaire en astrophysique (43 personnes) dans lequel s’insère l’équipe d’applications biomédicales (4 personnes). L’objectif principal de l’équipe est d’appliquer des techniques d’optique adaptative développées en astronomie aux instruments utilisés en microscopie dans le domaine des neurosciences. De la sorte, on améliorera la qualité d’image des microscopes pour nos collaborateurs de l’Institut de Biologie de l’ENS dans un premier temps, et pour toute la communauté des biologistes à terme ! Dans les 3 ans, un premier prototype sera développé au LESIA. Ensuite, nous l’installerons à l’IBENS pour que nos collaborateurs l’utilisent dans leurs recherches : imagerie fonctionnelle et structurelles de différents échantillons (cerveaux de rongeurs clarifiés, larves de zebrafish...). Améliorer les images fournies par les microscopes permettra d’observer des phénomènes biologiques à des échelles spatiales ou temporelles plus petites. L’étude des détails permettra d’avoir une vision plus globale des phénomènes observés et à terme, de mieux connaître et donc traiter les maladies neurodégénératives (sclérose en plaque...), véritables enjeux de santé publique.

L’équipe a des financements pour mener à bien les travaux de thèse qui commencent en janvier 2024 (achat de matériel, missions en conférence). D’autres financements seront demandés au fur et à mesure pour de nouvelles études.

Les biologistes cherchent en permanence à augmenter la résolution latérale et longitudinale de leur microscope. L’objectif principal de nos projets et d’augmenter ces résolutions en utilisant des techniques d’optique adaptative*.
–  Assurer la conception, la mise en exploitation et l’évolution de dispositifs expérimentaux complexes en microscopie à haute résolution angulaire pour l’imagerie biologique, utilisant l’optique adaptative*. L’objectif principal est d’appliquer des techniques d’optique adaptative* développées en astronomie aux instruments utilisés en microscopie pour les neurosciences.
–  Collaborer avec les différents partenaires (chercheurs biologistes, ingénieurs et techniciens de l’Institut de Biologie de l’ENS) sur les techniques d’imagerie de tissus biologiques ex vivo ou in vivo

–  étudier les besoins scientifiques des collaborateurs biologistes (résolution angulaire, résolution axiale, longueur d’onde de travail, champ d’observation, etc)
–  définir le cahier des charges fonctionnelles à partir des exigences fixées par les utilisateurs (biologistes) et rédiger le cahier des charges techniques pour le développement de l’instrument au LESIA
–  contribuer à la mise au point d’un instrument de microscopie assisté par optique adaptative*, en particulier, sur le plan de la conception optique assistée par logiciel.
–  proposer les techniques et méthodes d’optique adaptative* à utiliser dans l’instrument à partir des développements réalisés en astronomie, et principalement au LESIA
–  réaliser des mesures et les interpréter pour valider les performances de l’optique adaptative* sur un prototype de microscope en utilisant des échantillons biologiques ex-vivo
–  participer aux échanges et réunions entre l’équipe du LESIA et les collaborateurs biologistes

L’ensemble de ces activités se fera en étroite collaboration avec l’équipe "Applications biomédicales" constituée d’un thésitif, une ingénieure et deux chercheurs. L’ensemble des décisions seront prises collégialement.

–  Connaissance générale de la physique
–  Connaissances approfondies en optique géométrique et optique physique
–  Connaissances en optique adaptative*
–  Connaissances en différentes techniques de microscopie
–  Notions de traitement d’images
–  Notions d’imagerie en milieu diffusant
–  Connaissance de l’environnement de développement Python
–  Compétences en anglais scientifique et technique
–  Montage, alignement des bancs et réglages optiques
–  Notions de conception optique assistée par logiciel (Zemax, Code V..)
–  Programmer à partir d’un logiciel de traitement de données (IDL, Matlab, etc.) ou en Python
–  Capacité à intégrer un dispositif incluant des techniques optiques, optomécaniques, photoniques et informatiques
–  Maîtriser les techniques de présentation écrites et orales, de communication et d’animation de reunion

*L’optique adaptative est une technique optoélectronique "temps réel" qui permet de corriger les images dégradées par la présence de défauts optiques